Título: REDES NEURAIS PARA ANÁLISE DA AFINIDADE DE LIGAÇÃO DE COMPOSTOS ANTI-HIV
Autores: Duarte, Davi F.; Magalhães, Camila S.; Mol, Antônio C. A.; Caffarena, Ernesto R.
Resumo: A determinação rápida e acurada da afinidade de ligação entre ligantes e seus receptores, seria de enorme benefício para a área de desenho racional de fármacos. Este fato possibilitaria a análise da afinidade de um grande número de compostos antes que eles fossem quimicamente sintetizados e avaliados experimentalmente, agilizando o processo como um todo. Neste trabalho, a utilização de Redes Neurais Artificiais (RNA) para a análise da afinidade de ligação de compostos com potencial atividade anti-HIV é investigada. O método desenvolvido utiliza uma rede neural de regressão genérica (GRNN – General Regression Neural Network) para análise da afinidade de ligação com base nas informações estruturais e no modo de ligação dos compostos. Estruturas experimentais de 75 inibidores da enzima HIV-1 protease, com afinidade de ligação conhecida, foram obtidos do banco de estruturas moleculares Protein Data Bank (PDB) e utilizadas para treinamento e teste da rede neural. Foi desenvolvido um modelo para a representação das estruturas dos ligantes em uma matriz tridimensional, utilizada como entrada para a rede. A RNA foi estudada para discriminação de compostos em níveis de atividade. Os resultados indicam que o método desenvolvido pode se tornar uma ferramenta útil para o desenho racional de fármacos.
Palavras-chave: Afinidade de Ligação Receptor-Ligante; Redes Neurais Artificiais; HIV-1 Protease; AIDS
Páginas: 5
Código DOI: 10.21528/CBRN2009-186
Artigo em PDF: 186_CBRN2009.pdf
Arquivo BibTex: 186_CBRN2009.bib