Título: GeneBingo: Identificação De Genes Utilizando Rede Neural Artificial
Autores: Guizelini, Dieval; Pedrosa, Fábio de Oliveira; Marchaukoski, Jeroniza Nunes; Ferreira, Lucas Martins; Steffens, Maria Berenice Reynaud; Gehlen, Michelly Alves C.; Raittz, Roberto Tadeu
Resumo: Este artigo descreve uma nova aplicação computacional, o GeneBingo, para encontrar genes nos genomas microbianos. Os testes realizados apresentam um desempenho médio de 36,57% superior aos resultados obtidos pelo GLIMMER (aplicação mais utilizada para este fim). O GeneBingo explora a aplicação de Rede Neural Artificial para classificação das “Open reading frames” candidatas. Para desenvolvimento da rede foram identificadas características baseadas em métodos conhecidos como RBSFinder, FramePlot, percentual de GC e dicionários com regiões promotoras ou reguladoras.
Palavras-chave: Rede Neural Artificial; Open Reading Frames (ORF); Reconhecimento de Padrões; anotação de genomas
Páginas: 8
Código DOI: 10.21528/CBIC2011-34.6
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