Título: Modelando Unidades de Processamento Local no Cérebro da Drosófila Melanogaster em CircuitML
Autores: Chevitarese, Daniel Salles; Vellasco, Marley
Resumo: O mapeamento dos diversos circuitos neurais em unidades funcionais tem permitido cientistas estudarem esse sistema tão complexo. Por apresentar um repertório comportamental rico desempenhado por um circuito relativamente pequeno, a Drosófila Melanogaster se mostra como um estudo de caso interessante. Análises do conectoma da mosca, utilizando ferramentas de marcação genética e ferramentas avançadas de registro eletrofisiológico, permitiram que o circuito neural da mosca fosse mapeado em unidades funcionais, chamadas de Unidades de Processamento Local (LPU). Existem várias ferramentas disponíveis que permitem neurocientistas criarem um modelo preciso de todo o cérebro da mosca, mas nenhum deles fornece um método para especificar os circuitos de uma forma que ambos, biólogos e engenheiros, possam trabalhar juntos. Além disso, o desenvolvimento de modelos de LPU plausíveis requer a habilidade de especificar e instanciar sub-circuitos sem referência explícita a seus neurônios constituintes e suas ligações internas. Para este fim, apresentamos uma linguagem de especificação de circuito neural, chamada CircuitML, para construção de LPUs. A CircuitML foi concebida como uma extensão para NeuroML; a linguagem CircuitML proporciona construtos para definir sub-circuitos que compreendem primitivas neurais suportadas pela linguagem NeuroML. As LPUs e os sub-circuitos possuem uma interface que permite conexões com outras unidades funcionais através de padrões de conectividade definidos por blocos de conexão. A CircuitML foi usada para especificar um modelo modular baseado no sistema olfativo da mosca.
Palavras-chave: Drosófila Melanogaster; Modelos; Simulação; XML; Python
Páginas: 6
Código DOI: 10.21528/CBIC2015-026
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